"Найденный вариант помог приблизиться к молекулярно-генетическому объяснению глухоты у пациентов, у которых ранее выявляли только один рецессивный патогенный SLC26A4-аллель вместо двух, необходимых для рецессивного заболевания", - говорится в сообщении.
Наследственные патологии слуха - это нарушения, вызванные патогенными вариантами генов, участвующих в развитии и работе слуховой системы, это может быть как врожденная глухота, так и прогрессирующая тугоухость.
Ген SLC26A4, который стал объектом этого исследования, кодирует белок пендрин и преимущественно экспрессируется в тканях внутреннего уха, щитовидной железы и почек.
Патогенные варианты гена могут приводить к рецессивно наследуемой потере слуха и синдрому Пендреда, для которого характерны сенсоневральная тугоухость (связанная с поражением звуковоспринимающего отдела звукоанализатора) и дисфункция щитовидной железы.
В рамках работы исследователи изучили образцы ДНК 13 пациентов из Тувы с наследственной потерей слуха. У каждого из них при стандартном исследовании был найден только один патогенный вариант - так называемые М1-пациенты. Однако для развития рецессивной патологии требуется наличие патогенных вариантов в обеих копиях гена.
Для поиска изменений, которые могут не выявляться рутинными методами, ученые применили метод MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification), позволяющий обнаруживать протяженные делеции и дупликации. В результате, в образцах ДНК трёх М1-пациентов из двух родственных тувинских семей они нашли ранее не описанный вариант - тандемную дупликацию 12 нуклеотидов в одном из участков гена.
Эта дупликация может нарушать структуру и функцию белка. В пользу её связи с патологией также говорят данные родословных пациентов. Кроме того, этот вариант не нашли в контрольной выборке тувинцев и мировых базах геномных данных.
Ученые полагают, что этот новый вариант вместе с уже обнаруженным патогенным вариантом и приводит к потере слуха у пациентов, но для окончательного вывода необходимы функциональные исследования. Следующим этапом станут эксперименты in vitro на клеточных культурах. Они должны показать, действительно ли этот вариант патогенен и каким образом он влияет на белок пендрин: меняет ли его укладку или нарушает выполнение функций.
Исследователи также продолжат изучать наследственную потерю слуха в Туве и на Алтае, чтобы уточнить спектр генетических вариантов в этих популяциях.
Практическая ценность работы связана прежде всего с повышением точности молекулярно-генетической диагностики, что позволит своевременно определить тактику наблюдения и слуховой реабилитации.